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全自动柱层析的工作原理是通过位置反馈或压力反馈来控制电机的正转或反转运动来实现柱头自动升降；通过阀的通断和气动隔膜泵来实现胶的充填、回收。此外，层析时可与任何层析系统连接配套使用，以达到柱层析分离纯化药物。 新型的层析柱产品采用工作站和层析柱结合成一个层析柱平台，实现填料自动充填、填料自动回收、清洗柱管、旋转分离柱管、拆卸不锈钢筛网。

手动层析柱的工作原理是采用丝杆驱动上柱头，使柱头上升和下降；另外，通过小型旋转轮作用于柱头内腔中的驱动杠杆，使得其提升和下降，可促使柱头外侧的密封压紧环实现密封圈的压紧和松开，进而实现柱头的密封和解除密封。 还可以通过柱管上法兰的旋转螺钉实现上柱头的旋进和旋出，旋出时可以直接向柱管加入填料，同时可以清洗上筛网，晾干上筛网。旋进时可以直接旋转丝杆，驱动上柱头。 手动层析柱的工作原理是采用丝杆驱动上柱头，使柱头上升和下降；另外，通过小型旋转轮作用于柱头内腔中的驱动杠杆，使得其提升和下降。

专为生物层析开发，一端可调活塞，通过快速螺纹旋转可以迅速的对柱进行打开和装填密封，也能方便的拆卸进行零部件清洗。